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一、驳回商标注册申请的危害
在我国法律体系中，商标局对商标注册申请的审查以实质审查为原则。如果商标局认定申请人的注册申请违背法律禁止性规定，将依据职权驳回该注册申请。对于申请人来讲，一旦注册申请被驳回，可能发生如下损失。
1、经济损失。根据相关规定，商标注册申请被驳回的．商标局并不退还已收取的规费。商标代理组织一般也不退还所收取的代理费。这就意味着一旦商标注册申请被驳回，申请人需承担商标注册费用的损失。申请人就相同商标在几个甚至几十个类别中同时提出注册申请．如果该商标被认定为造成不良影响而驳回，其注册费的损失将是十分巨大的。
2、时间上的损失。商标注册申请被商标局核准注册前．很多申请人就已经开始使用该商标。而我国商标审查所需时间较长，在这段时间内由于申请人的使用以及推广宣传。申请复审商标已经具有较大的知名度。一旦该商标注册申请被商标局驳回，申请人以往的努力将付之东流。
而且根据《海关保护知识产权条例》的规定，海关对商标权的保护仅限于注册商标。非注册商标受海关保护力度较低。如果申请人的商标注册申请被商标局驳回，即使申请人可以通过驳回复审程序使该商标核准注册．但由于商标驳回复审案件审查期间较长．在此期限内将影响该商标获得海关保护的进程。
3、法律成本。商标注册申请被驳回将产生的法律风险主要有以下两点：
其一，如果申请人在中国提出注册申请后根据《商标国际注册马德里协定》提出了商标国际注册申请。一旦该商标被商标局驳回，根据中心打击原则，申请人提出国际注册申请将因基础注册无效而被驳回。
其二、商标注册申请被商标局依据《商标法》第28条认定为与在先注册的引证商标近似而驳回该注册申请．如果申请人在法定期限内没有提出驳回复审申请或者驳回复审申请理南不成立，那么该裁定对申请商标与引证商标相近似的认定发生法律效力。如果申请人已经使用该商标，那么引证商标权人可以依据该裁定主张申请人的使用行为构成商标侵权而要求申请人承担侵权责任。
综上．如果商标注册申请被商标局驳回，将对申请人的权益产生较大影响。因而在商标申请过程中，应尽量避免注册申请被驳回。但在实际操作过程中．商标注册存在一定的风险，申请人注册风险的控制力较弱，如何规避风险是商标注册过程中的重要工作内容。
二、办理商标注册申请的风险
商标注册过程中可能存在的风险如下：
1、与他人在先商标注册申请相近似
虽然国家工商管理总局已经开放了商标查询系统．但是中国商标网上所提供的商标查询服务存在一定的不足。首先该系统存在六个月的盲查期．对于六个月内提出的注册申请无法通过该系统查询。其次，虽然该系统可以较为准确地查询出在先注册的相同商标，但是对于近似商标的查询仍存在较大的不足。第三，该系统是通过对图形要素的描述来查询图形商标的。由于查询者与商标信息录入者对商标构成要素的认识不同，使得商标查询系统仍不能准确查询图形商标。最后，该系统对于商标使用商品类似性的查询只能精确到类别，无法精确到每一件商品，无法准确的查询到类似群组的类似商品上使用的近似商标。
而在审查过程中对于近似商标与类似商品的判定依靠审查员的自由裁量权、尤其是图形商标并无严格统一的审查标准。即使对在先注册商标的准确查询，商标局也有可能依据《商标法》第28条予以驳回。
2、违背禁止性规定
我国《商标法》第10条对商标做出禁止性规定。但是在商标注册申请实务中申请人不可能先知先觉熟知社会各个行业。所申请的注册商标很容易违背该规定。例如根据该规定，县级以上行政区划、外国知名城市与造成不良影响的标识不得作为商标使用。但是我国有上千个县级行政区划．申请人在注册商标时不可能对此完全熟知。对于外国知名城市更不可能全部知悉。申请人的注册行为并没有混淆相关公众的恶意，但由于所申请商标在客观上与县级以上行政区划相同．使得该商标注册申请被商标局驳回。
在审查实践中对于宗教词汇一般禁止作为商标注册。然而生活中由于很多申请人并不信奉宗教．无法认识到一些已经生活化的宗教术语所蕴含的宗教含义。而这样的商标在申请过程中极易被商标局依据《商标法》第十条所驳回。例如北京某公司将其经营的网络游戏“天龙八部”申请为注册商标。商标局依据《商标法》第十条驳回了其注册申请。
3、缺乏显著性
根据《商标法》第1l条规定，说明使用商品特征、品质的标识不得作为注册商标。根据商标法基本原理，根据商标与使用商品的关系分为臆造商标、叙述商标、指示商标。叙述商标和指示商标与商标使用商品关联性较强，很容易被认定为对商品特征的描述而驳回注册申请，该类商标在注册中存在一定风险。
对于臆造商标，虽然其与商标申请使用商品关联性较低。但是实践中当一件商标的知名度达到一定程度后，申请人为了保护该商标的市场价值。往往将其在所有的商品类别上注册，这时就产生一定的风险。例如“苹果”电脑在第九类商品中的电脑商品上并非对商品的描述，符合法律要求。然而要是将其推广在第31类商品巾的水果这一商品上，显然是对该商标申请使用商品的描述。